西漢時期始設昌平縣。

明正德元年（1506）縣升為州，公元1913年撤州設縣。

1949年4月昌順聯(lián)合縣分社昌平縣，屬察哈爾省南口專區(qū)；8月1日起屬河北省通縣專區(qū)。

1956年3月9日國務院全體會議第25次會議決定：撤銷昌平縣，將昌平縣所屬行政區(qū)域（高麗營鎮(zhèn)除外）劃歸北京市，并命名為昌平區(qū)。

1960年1月7日國務院批準，撤銷昌平區(qū)，恢復昌平縣。

1999年9月16日，《國務院關于同意北京市撤銷昌平縣設立昌平區(qū)的批復》國函〔1999〕112號，撤銷昌平縣，設立昌平區(qū)，以原昌平縣的行政區(qū)域為昌平區(qū)的行政區(qū)域，區(qū)人民政府駐政府街。

2022年，昌平區(qū)下轄8個街道、14個鎮(zhèn)。