北宋乾德三年（965年），置云門鎮(zhèn)，屬合州石照縣。

清雍正六年（1728年），屬合州明月里。

民國二十年（1931年），屬第五區(qū)。

民國二十一年（1932年），屬第三區(qū)，為區(qū)公所駐地。

民國二十八年（1939年），云門鎮(zhèn)與渠嘉鄉(xiāng)合并設(shè)云渠鎮(zhèn)。

民國三十年（1941年），云渠鎮(zhèn)析設(shè)渠嘉鄉(xiāng)，復(fù)為云門鎮(zhèn)。

1949年12月下旬，屬第四區(qū)，為區(qū)公所駐地。

1952年7月，云門鎮(zhèn)析設(shè)建設(shè)、涼水鄉(xiāng)。

1956年1月，建設(shè)、涼水鄉(xiāng)合并成立云門鄉(xiāng)。

1958年9月，云門鎮(zhèn)與云門鄉(xiāng)合并建云門公社。

1965年3月，云門公社析置云門鎮(zhèn)。

1968年，云門公社改名衛(wèi)東公社。

1972年，恢復(fù)云門公社原名。

1983年12月，云門公社改為云門鄉(xiāng)。

1985年2月，云門鄉(xiāng)并入云門鎮(zhèn)。

1993年12月，渠嘉鄉(xiāng)并入云門鎮(zhèn)。

2001年6月，天星鎮(zhèn)并入云門鎮(zhèn)。

2005年4月，高龍鎮(zhèn)并入云門鎮(zhèn)。

2009年12月，撤云門鎮(zhèn)設(shè)云門街道。