1958年4月，樊家廟村隸屬于樊家廟鄉(xiāng)。

1958年9月，樊家廟、肖原、城關(guān)三個(gè)鄉(xiāng)合建為慶豐公社，樊家廟村改稱樊家廟大隊(duì)隸屬于慶豐公社。

1961年5月，增設(shè)玄馬人民公社管委會(huì)。

1962年2月，增設(shè)賈橋人民公社管委會(huì)。

1965年2月，賈橋、玄馬兩公社合并為玄馬公社，樊家廟大隊(duì)隸屬于玄馬公社。

1968年3月，成立玄馬人民公社革委會(huì)，樊家廟大隊(duì)隸屬關(guān)系未變。

1980年6月，玄馬人民公社革委會(huì)改名為玄馬人民公社管委會(huì)，樊家廟大隊(duì)隸屬于玄馬人民公社管委會(huì)。

1983年12月，玄馬人民公社管委會(huì)改為玄馬鄉(xiāng)人民政府，樊家廟大隊(duì)改稱樊廟村民委員會(huì)。

2003年1月，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，改稱玄馬鎮(zhèn)人民政府樊廟村民委員會(huì)至今。