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明洪武年(1381年)麥?zhǔn)夏舷蓶|莞長安遷徙,于明永樂年(1423年)在合水口開基立村。
1949年10月合水口村屬于寶安縣公明鄉(xiāng)管轄。
1961年7月,合水口一分為三,分為上屯、中屯、下屯三個大隊,屬于公明人民公社。
1963年2月,公明公社又將其合并為合水口大隊。
1979年1月,寶安縣升格為深圳市后,公明公社歸屬當(dāng)時的市設(shè)七區(qū)之一松崗區(qū)。
1983年公明公社更名為公明區(qū),成為寶安縣派出行政管理部門,合水口設(shè)立鄉(xiāng)政府。
1993年1月原深圳市寶安縣公明鎮(zhèn)合水口村改為深圳市寶安區(qū)公明鎮(zhèn)合水口村。
2004年7月,因城市化改制,更名為合水口社區(qū)居委會,名稱沿用至今,隸屬馬田街道。