明朝中葉（約1460年），福建莆田馬、丁、洪等姓到此創(chuàng)村定居，稱三灣村。

前屬饒平縣。

明嘉靖四十二年（1563）屬澄海縣蘇灣都。

清康熙二十五年（1686）三灣村改稱灣興村。

1914年灣興村析為南灣、北灣和東灣三鄉(xiāng)。

1921年廢都設(shè)區(qū)，屬蘇南區(qū)。

1946年南灣與北灣、東灣、渡亭合稱灣渡鄉(xiāng)。

1951年屬海濱區(qū)。

1953年屬二區(qū)。

1956年灣頭片合稱東灣鄉(xiāng)。

1957年東灣鄉(xiāng)改稱灣頭鄉(xiāng)。

1958年成立澄�？h人民公社，屬第一支隊，南灣與南份合稱101團(tuán)。

1959年南份析出，設(shè)南灣生產(chǎn)大隊，屬蘇南人民公社。

1968年屬東方紅人民公社。

1972年屬灣頭人民公社。

1984年1月設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)，南灣、南份合設(shè)南灣鄉(xiāng)，屬灣頭區(qū)。

1986年11月撤區(qū)置鎮(zhèn)，南份析出，設(shè)南灣村，屬灣頭鎮(zhèn)。

1990年9月設(shè)南灣管理區(qū)。

1999年6月設(shè)南灣村。

2002年屬蓮下鎮(zhèn)，沿用至今。