1949年10月，玉樹村屬番禺縣。

1953年6月，玉樹屬廣州市黃埔區(qū)。

1955年6月，玉樹屬廣州市郊區(qū)黃村鄉(xiāng)。

1958年2月，玉樹屬廣州市郊區(qū)東圃人民公社管轄。

1964年，玉樹村劃歸郊區(qū)知青農(nóng)場。

1969年，玉樹村由廣州市郊區(qū)劃入越秀區(qū)管轄。

1971年，玉樹村屬農(nóng)場局領導下的新塘農(nóng)工商聯(lián)合公司。

2000年9月，玉樹村劃屬廣州市天河區(qū)東圃鎮(zhèn)。

2002年底，廣州市天河區(qū)東圃鎮(zhèn)撤鎮(zhèn)設街，玉樹村劃歸天河區(qū)新塘街。

2003年1月，玉樹村由天河區(qū)新塘街劃屬廣州經(jīng)濟技術開發(fā)區(qū)夏港街。

2004年5月26日，廣州開發(fā)區(qū)聯(lián)和街辦事處成立，玉樹村由開發(fā)區(qū)夏港街劃歸聯(lián)和街管轄。

2005年5月，玉樹村完成“村改居”，成立玉樹社區(qū)居民委員會，2014年，改屬黃埔區(qū)并沿用至今。