明、清時期，長垌隸屬柳州府象縣。

清宣統(tǒng)元年（1909年），金秀大瑤山設4個瑤團，長垌系滴水團。

民國二十九年（1940年），屬象縣下轄的東北鄉(xiāng)，屬象縣與金秀設治局雙重管轄。

1949年10月，國民黨金秀設治局遷駐東北鄉(xiāng)長垌屯。

1951年10月，象縣在長垌設區(qū)，為第八區(qū)，又稱東北自治區(qū)。

1952年5月，大瑤山瑤族自治區(qū)（縣級）成立，劃歸金秀大瑤山管轄。

1958年8月，改為長垌幸福公社。

1962年8月，恢復長垌區(qū)。

1968年12月，改為長垌公社。

1984年10月，改為長垌鄉(xiāng)人民政府。