明朝時期屬龍城里,清朝時期屬后歸仁鄉(xiāng),民國時期屬歸仁鄉(xiāng),設(shè)立十三保(天井坪);中華人民共和國成立后,1950年5月歸屬天井村,屬兩河區(qū);1953年1月歸屬天井鄉(xiāng),屬第四區(qū)(營盤);1956年3月小鄉(xiāng)合并后建立三星農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社,屬第四區(qū)(營盤)天井鄉(xiāng);1958年11月人民公社化時,設(shè)立三星大隊(duì),屬磨坪人民公社天井管理區(qū);1961年4月設(shè)區(qū)建社時屬磨坪區(qū)天井人民公社;1975年10月撤區(qū)并社后屬磨坪人民公社天井管理區(qū);1981年3月,三星大隊(duì)更名為三墩巖大隊(duì);1984年2月三墩巖大隊(duì)改稱為三墩巖村,屬磨坪區(qū)天井鄉(xiāng);1987年9月鄉(xiāng)鎮(zhèn)合并后屬磨坪鄉(xiāng);2001年3月合村并組后,為三墩巖村,屬磨坪鄉(xiāng)至今。