清雍正末年，鮮姓等氏先民為避水災，從宜昌的宜都先到巴東兔兒坪，后輾轉遷來此地，見此地有一溪溝，下雨有水，平常無水，便將此地稱為干溝。

民國七年（1918）屬禮字區(qū)；民國三十八年（1949）屬高店子鄉(xiāng)；1950年廢除保甲制，屬高坪區(qū)管轄，命名為干溝村；1958年人民公社化時，屬高龍公社管轄，更名為光明大隊；1961年恢復區(qū)建制，屬高坪區(qū)管轄，仍名為光明大隊；1975年撤區(qū)并社，屬高坪公社管轄，仍名為光明大隊；1984年撤社建區(qū)鄉(xiāng)，屬高坪區(qū)管轄，將光明大隊更名為干溝村；1996年撤區(qū)建鄉(xiāng)，屬高坪鄉(xiāng)管轄，仍名為干溝村；1997年調整建制，屬高坪鎮(zhèn)管轄，名為干溝村村民委員會至今。