1948年8月屬信隨縣祝林區(qū)。

1949年2月屬河南省信陽(yáng)縣祝林區(qū)。

1949年11月屬隨縣祝林區(qū)。

隨后，實(shí)行區(qū)管小鄉(xiāng)制，分別為祝林鄉(xiāng)、大善鄉(xiāng)和罐子溝鄉(xiāng)，屬祝林區(qū)。

1956年3月屬殷店區(qū)祝林鄉(xiāng)。

1958年9月成立人民公社，分別命名為燈塔大隊(duì)、大山大隊(duì)和森林大隊(duì)，屬燈塔（草店）公社祝林管理區(qū)。

1959年1月屬殷店公社。

1960年12月復(fù)屬草店公社祝林管理區(qū)。

1961年6月屬草店區(qū)祝林公社。

1975年9月屬小林公社祝林管理區(qū)。

1981年地名普查時(shí)，燈塔大隊(duì)、大山大隊(duì)分別更名為祝林店大隊(duì)和大善寺大隊(duì)，森林大隊(duì)不變，屬小林公社祝林管理區(qū)。

1984年設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)、撤隊(duì)改村，祝林店大隊(duì)、大善寺大隊(duì)和森林大隊(duì)分別更名為祝林店村、大善寺村和粉坊村，其中大善寺村屬小林鎮(zhèn)，祝林店村和粉坊村屬淮河區(qū)祝林鄉(xiāng)。

1987年9月，屬小林鎮(zhèn)。

2004年10月三村合并為祝林店村，屬小林鎮(zhèn)至今。