春秋戰(zhàn)國時(shí)期，先后屬吳國、越國和楚國。

漢高祖六年（前201），置高郵縣。

三國時(shí)廢。

晉太康元年（280），復(fù)置，屬臨淮郡。

南朝時(shí)析置臨澤縣、竹塘、三歸三縣，置廣業(yè)郡，尋改神農(nóng)郡。

隋開皇初郡廢，并省竹塘、三歸、臨澤三縣入高郵，屬揚(yáng)州。

唐代屬揚(yáng)州。

宋開寶四年（971），置高郵軍。

元至元十四年（1277），置高郵路，二十一年改高郵府，屬揚(yáng)州路。

明洪武元年（1368），改為州，屬揚(yáng)州府。

1912年，改州為縣。

1949年，屬蘇北行署區(qū)泰州專區(qū)。

1952年，屬江蘇省揚(yáng)州專區(qū)。

1970年，屬揚(yáng)州地區(qū)。

1983年3月，劃歸揚(yáng)州市。

1991年2月，撤縣設(shè)高郵市。