宋始屬來(lái)春鄉(xiāng)，清屬虞門鎮(zhèn)。

1927年屬虞門鄉(xiāng)，1948年為葫橋鄉(xiāng)，1949年為于門鄉(xiāng)。

1957年為申港鄉(xiāng)第1高級(jí)社，1958年為申港公社1大隊(duì)，1982年分為1大隊(duì)和于門大隊(duì)。

1984年分別更名為申港鄉(xiāng)錢家巷村村民委員會(huì)和于門村村民委員會(huì)。

2002年兩村合并后為申港鎮(zhèn)于門村村民委員會(huì)。

2008年為申港街道于門村村民委員會(huì)，2013年行政區(qū)劃調(diào)整后為臨港街道于門村村民委員會(huì)。

2017年10月臨港街道撤銷，恢復(fù)成申港街道于門村村民委員會(huì)。