1949年前夕屬贛縣直屬區(qū)水西鄉(xiāng)第8保；1949年初屬贛縣水西區(qū)水西鄉(xiāng)，名湖邊村；1950年屬湖邊區(qū)龍嶺鄉(xiāng)（后名背坑鄉(xiāng)）；1952年屬湖邊區(qū)湖邊鄉(xiāng)；1956年撤區(qū)，仍屬湖邊鄉(xiāng)；1958年9月名紅旗公社湖邊管理區(qū)湖邊工區(qū)；1959年10月名湖邊大隊，屬湖邊公社；1961年4月隨公社劃屬贛州市，同年11月隨公社復歸贛縣；1965年6月撤區(qū)，仍名湖邊公社湖邊大隊；1978年1月隨公社再從贛縣劃入贛州市；1984年4月公社改鄉(xiāng)后，名湖邊村，屬湖邊鄉(xiāng)。

1998年經(jīng)省政府批準，撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)，名湖邊鎮(zhèn)湖邊村。