以南宋乾道八年（1172）內(nèi)捍海塘修筑為標(biāo)志，祝橋鎮(zhèn)境域漸次成陸，百姓逐漸移居，祝橋地區(qū)隸屬松江府上�？h。

明隆慶二年（1568），松江府清丈土地，分團編甲，造業(yè)戶魚鱗冊，今祝橋地區(qū)始有五團之名，當(dāng)時的祝橋境域隸于下砂鹽場，僅有團灶機構(gòu)而無行政建置。

民國23年（1934），南匯縣合并區(qū)治，原五團鄉(xiāng)境域隸屬于南匯縣第二區(qū)。

至1936年，祝橋集鎮(zhèn)市場繁榮，成為南匯縣第五大鎮(zhèn)。

民國36年（1947）春，恢復(fù)五團鄉(xiāng)建置。

1949年5月五團鄉(xiāng)（祝橋地區(qū)）解放，成立蘇南行政公署松江專區(qū)南匯縣人民政府，祝橋、鹽倉、東海地區(qū)隸屬祝橋區(qū)管轄。

1958年9月成立東方紅人民公社，祝橋、鹽倉、東海地區(qū)屬東方紅人民公社。

1962年3月從鹽倉人民公社劃出10個生產(chǎn)大隊、祝橋人民公社劃出3個生產(chǎn)大隊，成立東海人民公社。

1984年2月實行政社分設(shè)，建立祝橋鄉(xiāng)、鹽倉鄉(xiāng)、東海鄉(xiāng)。

1994年9月，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，改名祝橋鎮(zhèn)，實現(xiàn)鎮(zhèn)管村體制。

2003年撤銷原祝橋鎮(zhèn)、鹽倉鎮(zhèn)、東海鎮(zhèn)建制，建立新的祝橋鎮(zhèn)。

2006年12月朝陽農(nóng)場并入祝橋鎮(zhèn)。

2011年施灣、江鎮(zhèn)社區(qū)從川沙新鎮(zhèn)劃歸祝橋鎮(zhèn)。