清順治年間為南董,屬太平縣管轄。
民國3年(1914年),國民政府改太平縣為汾城縣,屬汾城縣管轄。
1954年9月,兩縣合并,歸襄汾縣管轄。
1958年10月人民公社化,撤銷鄉(xiāng)建制,實行政社合一。
隸屬紅旗公社。
1959年1月,襄汾縣撤銷,屬侯馬市管轄。
1961年7月恢復襄汾縣建制,隸屬襄汾縣管轄。
幾經變更,到1979年底為南董大隊,歸永固公社管轄。
1984年2月改行鄉(xiāng)鎮(zhèn)制,改稱為南董村民委員會,隸屬永固鄉(xiāng)管轄。
2019年12月仁佑村并入南董村,隸屬永固鄉(xiāng)管轄至今。