阿科里鄉(xiāng)境域舊屬綽斯甲宣撫司,大金卡蘇等地屬大金川安撫司。
民國(guó)二十四年(1935年),綽斯甲土司改綽斯甲縣,阿科里屬之。
民國(guó)二十五年(1936年)7月,紅軍北上后,廢縣,恢復(fù)土司制。
1960年1月,設(shè)阿科里鄉(xiāng);同年3月,建國(guó)營(yíng)牧場(chǎng),駐大草塘。
1964年,二嘎里文布溝建國(guó)營(yíng)二牧場(chǎng),阿科里國(guó)營(yíng)牧場(chǎng)更名國(guó)營(yíng)一牧場(chǎng)。
1966年,撤阿科里鄉(xiāng),6牧業(yè)大隊(duì)劃歸國(guó)營(yíng)一牧場(chǎng)。
1984年,改阿科里鄉(xiāng)。
1985年7月,撤國(guó)營(yíng)一牧場(chǎng)。
2002年3月,分為阿科里、毛日2鄉(xiāng)。
2020年6月,將阿科里鄉(xiāng)卡蘇村所屬行政區(qū)域劃歸獨(dú)松鄉(xiāng)管轄。