漢代為莎車國地。

《漢書·西域傳》:“莎車國，王治莎車城。”神爵三年(59)隸西域都護(hù)府。

三國、北魏時(shí)稱渠莎，屬疏勒。

隋、唐以后并人于闐。

宋屬喀喇汗王朝。

南宋屬西遼。

元代為察合臺(tái)后王封地。

明代曾為東察合臺(tái)汗國及葉爾羌汗國王城。

清乾隆二十六年(1761)設(shè)葉爾羌辦事大臣。

光緒九年(1883)置莎車直隸州，州治莎車，領(lǐng)轄葉城縣。

光緒二十八年(1902)直隸州升為莎車府，隸喀什噶爾道。

莎車本府即今莎車縣前身。

1913年莎車本府改為莎車縣，仍隸喀什噶爾道。

1929年莎車縣分成莎車、葉爾羌兩縣。

1942年析喀什行政區(qū)置莎車行政區(qū)。

1943年兩縣復(fù)并為莎車縣，同年改為莎車督察專區(qū)。

1949年后為莎車專署駐地。

1956年莎車專區(qū)撒消、歸喀什專區(qū)。

1970年后屬喀什地區(qū)。