1959年西藏民主改革后雪巴宗縣管轄拉格克納等。

1960年設(shè)百巴、白拉、拉嘎、開(kāi)朗4鄉(xiāng)，屬雪巴縣拉嘎區(qū)。

1964年，撤銷雪巴縣，拉嘎區(qū)及其所轄鄉(xiāng)劃歸林芝縣。

同年，拉嘎區(qū)更名為百巴區(qū)。

1965年，百巴區(qū)增設(shè)強(qiáng)嘎鄉(xiāng)。

1969年百巴區(qū)更名為紅星區(qū)。

1971年，紅星區(qū)所轄鄉(xiāng)改為人民公社。

1977年紅星區(qū)復(fù)稱為百巴區(qū)。

1984年百巴區(qū)所轄人民公社復(fù)鄉(xiāng)。

1988年4月在全區(qū)撤區(qū)并鄉(xiāng)中，撤銷百巴區(qū)，將原拉嘎、白拉、強(qiáng)嘎、開(kāi)朗、百巴5鄉(xiāng)合并，設(shè)置百巴鄉(xiāng)，直屬林芝縣。

1999年6月，在全區(qū)行政區(qū)劃調(diào)整中，設(shè)立百巴鎮(zhèn)，屬林芝縣管轄。

2015年3月，撤銷林芝縣設(shè)立縣級(jí)巴宜區(qū)，百巴鎮(zhèn)直屬巴宜區(qū)。