7世紀(jì)中葉，吐蕃政權(quán)建立后，把日喀則一帶地區(qū)劃歸如拉茹管轄，在其境內(nèi)設(shè)立“桑珠孜”“娘達(dá)”“域參”。

9世紀(jì)中葉，歸杰氏氏族統(tǒng)治。

10世紀(jì)初，達(dá)瑪鄔東贊后裔吉德一族占據(jù)年楚河流域，形成“卓地王系”，將日喀則收歸治下。

元至元十四年（1354，藏歷第六饒迥木馬年），明廷及帕木竹巴政權(quán)在今日喀則市設(shè)立桑珠孜宗。

明正統(tǒng)十二年（1447，藏歷第七饒迥火兔年），修建扎什倫布寺。

16世紀(jì)中葉，辛夏巴•才旦多吉以桑珠孜為中心，建立起“第巴藏巴汗政權(quán)”，稱“藏堆杰波”（后藏之王）。

清康熙十八年（1679，藏歷第十一饒迥土羊年），設(shè)立“甲錯(cuò)宗”“昔孜宗”“夏魯宗”。

1921年，西藏地方政府在今桑珠孜區(qū)設(shè)“日喀則宗”“蘭倫繞溪”，隸屬日喀則基宗。

1952年6月，蘭倫繞溪卡歸還班禪堪布會(huì)議廳管轄。

1954年，西藏地方政府將日喀則基宗改稱“藏區(qū)總管”，日喀則宗隸屬其管轄。

1960年1月，撤銷日喀則宗和蘭倫繞溪，合并設(shè)置日喀則縣，隸屬日喀則專區(qū)。

1962年1月，卡孜鄉(xiāng)、土布加鄉(xiāng)和艾馬崗區(qū)及其所轄的艾馬鄉(xiāng)、恰熱鄉(xiāng)、山巴鄉(xiāng)、扎西鄉(xiāng)、孜東鄉(xiāng)、普孜鄉(xiāng)，共1個(gè)區(qū)，8個(gè)鄉(xiāng)從日喀則縣劃出，歸南木林縣管轄。

1986年12月，日喀則縣改為日喀則市（縣級(jí)）。

2014年6月，撤銷縣級(jí)日喀則市，設(shè)立日喀則市桑珠孜區(qū)。